La nouvelle armoire Cray exploitant ECOphlex exploite au choix, le système de refroidissement par air déjà installé dans l'entreprise cliente ou la nouvelle technologie transformant un liquide inerte (R134a) en gaz. Il peut aussi utiliser de l'eau froide à différentes températures, réduisant ainsi la nécessité d'aligner de nombreux CRAC pour absorber la chaleur. Cray rappelle qu'actuellement, la plupart des supercalculateurs expulsent la chaleur dans l'air, celle-ci étant ensuite récupérée par un système d'air conditionné (CRAC, computer room air conditioner). Une méthode que le constructeur juge très peu efficace, puisque le CRAC peut parfois occuper davantage de place que l'ordinateur lui-même, et consommer autant d'électricité. D'autres technologies de refroidissement utilisent des circuits d'eau froide dans chaque armoire d'ordinateur, parfois jusqu'au milieu des serveurs lames. Cray se classe 111ème au Green 500 des supercalculateurs